Kvantitatív Parazitológia 3.0

 

Ez az angol nyelvű szoftver statisztikailag korrekt eszköztárat nyújt a parazitákra jellemző aggregált (jobbra-ferde) gyakorisági eloszlások elemzésére. A QP3.0 alkalmas az élősködők általi fertőzöttség leírására a gazdaegyedek egyetlen mintájában, vagy több minta közt a fertőzöttség különbségeinek statisztikai elemzésére.

  

A QP3.0 letöltése és telepítése

(önkicsomagoló exe fájl egy tömörített mappában)

 

QP on the Web

(ez egy interaktív on-line felület)

 

 

Tudományos és oktatási célokra a QP minden verziója ingyenesen letölthető, használható és terjeszthető.

Tudományos dolgozatokban azonban kérjük a szoftvert az alábbi formában citálani:

 

"Reiczigel J, Rózsa L 2005. Quantitative Parasitology 3.0. Budapest.  Distributed by the authors. "

 

Jó alternatíva, ha a felhasználók a QP elvi alapjait összefoglaló cikkünket idézik:

  

  Rózsa L, Reiczigel J, Majoros G 2000. Quantifying parasites in samples of hosts. Journal of Parasitology 86: 228-232.

 

Felhívjuk a figyelmet arra, hogy a QP3.0 néhány biostatisztikai funkciója még nem szerepelt a fenti dolgozatban, azokat az alább sorolt újabb dolgozatokban ismertettük.

 


 

Futtatás

 

A QP3.0 csak Windows alatt futtatható. Az exe fájl letöltése és kicsomagolása egy 'QP30' nevű mappát eredményez. A fájlokat ne távolítsd el ebből a mappából. A mappában

  

     •  jobb egérgombbal klikkelj a '_qp30.exe' nevű fájlra,

     •  majd válaszd ki a 'futtatás rendszergazdaként' ('run as administrator') funkciót.

 


 

Miért alkalmazunk számos különböző biostatisztikai elemzést egymással párhuzamosan?

Hogyan válasszam ki a saját elemzéseim során szükséges biostatisztikai funkciókat?

  E rövid technikai útmutató (angol nyelven) segítséget nyújt ebben.

 


 

A QP3.0-ban elérhető statisztikai eszközök

 

1. A fertőzöttség mérőszámainak kiszámítása a gazdaegyedek egyetlen mintájában:

Leíró statisztikák (egyedszám, prevalencia, átlag és medián intenzitás, abundancia variancia/átlag),

Két alternatív lehetőség a prevalencia konfidencia intervallumának kiszámítására:

          Clopper - Pearson módszer (ez egy hagyományosabb eljárás),

          Sterne (vagy Wald) módszer (fejlettebb módszer, lásd Reiczigel 2003),

Az átlagos intenzitás bootstrap (BCa) konfidencia intervalluma,

A medián intenzitás egzakt konfidencia intervalluma,

Az átlagos abundancia bootstrap (BCa) konfidencia intervalluma,

Az átlagos zsúfoltság bootstrap (BCa) konfidencia intervalluma (lásd Reiczigel et al. 2005a),

Aggregáltsági indexek (abundancia variancia/átlag, diszkrepancia index, negatív binomiális k),

2. A fertőzöttség mérőszámainak összehasonlítása a gazdaegyedek két mintája közt: 

Leíró statisztikák (egyedszám, prevalencia, átlag és medián intenzitás, abundancia variancia/átlag),

Két alternatív lehetőség a prevalenciák összehasonlítására:

          Chi-négyzet Teszt (ez egy hagyományosabb eljárás),

          Fisher-féle Egzakt Teszt (ez egy jobb módszer),

'Unconditional' Teszt  (ez egy fejlettebb módszer, lásd Reiczigel et al. 2008.)   (2010. febuár 1.)  

Bootstrap t-Teszt az átlagos intenzitások összehasonlítására,

Mood-féle Medián Teszt a medián  intenzitások összehasonlítására,

'Stochastic equality' Teszt az intenzitás gyakorisági eloszlásainak összehasonlítására (lásd Reiczigel et al. 2005b),

Bootstrap t-Teszt az átlagos abundanciák összehasonlítására,

Az átlagos zsúfoltságok összehasonlítása (lásd Reiczigel et al. 2005a),

3. A fertőzöttség mérőszámainak összehasonlítása a gazdaegyedek három vagy több mintája közt: 

Leíró statisztikák (egyedszám, prevalencia, átlag és medián intenzitás, abundancia variancia/átlag),

Két alternatív lehetőség a prevalenciák összehasonlítására:

          Chi-négyzet Teszt (ez egy hagyományosabb eljárás),

          Fisher-féle Egzakt Teszt (ez egy jobb módszer),

Mood-féle Medián Teszt a medián  intenzitások összehasonlítására.

 


 

További olvasmányok

 

A QP3.0-ban elérhető egyes statisztikai eszközök ismertetése nem a fent citált 2000-es cikkünkben, hanem az alábbi, későbbi cikkeinkben lelhetők fel. Ha kutatómunkádban felhasználod, kérjük citáld az adott eljáráshoz tartozó cikket.

 

 Reiczigel J 2003. Confidence intervals for the binomial parameter: some new considerations. Statistics in Medicine 22: 611-621.

 Reiczigel J, Lang Z, Rózsa L, Tóthmérész B 2005. Properties of crowding indices and statistical tools to analyze crowding data. Journal of Parasitology 91: 245-252.

 Reiczigel J, Zakariás I, Rózsa L 2005. A bootstrap test of stochastic equality of two populations. The American Statistician 59: 156-161.

 Reiczigel J, Abonyi-Tóth Z, Singer J 2008. An exact confidence set for two binomial proportions and exact unconditional confidence intervals for the difference and ratio of proportions. Computational Statistics and Data Analysis 52: 5046-53.

 


  

Elhárított hiba

A QP2.0 változatban az átlagos intenzitás és az átlagos abundancia konfidencia intervallumának számításában volt egy apró hiba, ami az eredményeket kismértékben torzította. A 2003. április 2. után letöltött valamennyi QP verzió mentes ettől a hibától.

  

Kapcsolat

Biostatisztikai és számítástechnikai kérdések kapcsán a reiczigel.jeno (at) gmail.com, biológiai és járványtani kérdések kapcsán a lajos.rozsa (at) gmail.com címen kérhető tanács.

  

Támogatás

Munkánkat az MTA, az OTKA (T 049157), és a Szent István Egyetem (NKB 2001-KUT-5-018) támogatta.

  

Szerzői jogok

A fenti dolgozatok lektorált nemzetközi szakfolyóiratokban jelentek meg. A terjesztés joga a kiadókat illeti meg, engedélyük nélkül e cikkek nem terjeszthetők. E weblapon tudományos és oktatási célból, csak megtekintésre szerepelnek.

 

A lap eredeti angol nyelvű változata 2001. 11. 27.,

a magyar nyelvű változata 2014. 08. 27. óta elérhető.

Utolsó változtatás: 2017. 08. 02.  

  A lapot RÓZSA Lajos gondozza.

vissza

Locations of visitors to this page